【摘 要】 目的 探讨实时荧光定量PCR（FQ-PCR）技术在手足口病（HFMD）病原体检测中的应用，了解遵义市HFMD流行特征。 方法 收集2015年5~7月该院儿科初步诊断为HFMD的85例患儿的咽拭子、疱疹液标本，采用FQ-PCR检测标本中肠道通用型病毒（EV-U）、肠道病毒71型（EV71）及柯萨奇病毒A组16型（CoxA16），同时与酶联免疫吸附试验（ELISA）检测结果进行比较分析。 结果 85例 HFMD患儿采用FQ-PCR法检出65例EV-U阳性，阳性率为 76.5％，其中2岁以下年龄段患儿阳性40例，阳性率为80.0%（40/50），2～5岁患儿阳性25例，阳性率为71.4%（25/35）。ELISA法检测EV-U阳性52例，其中2岁以下年龄段患儿阳性31例，阳性率为62.0%（31/50），2～5岁年龄段患儿阳性21例，阳性率为60.0％（21/35）。2种方法检测阳性率比较，差异有统计学意义（P<0.05）。 结论 FQ-PCR技术以其灵敏度高、特异性强、速率快等特点更适用于临床检测HFMD病原体。2015年遵义市HFMD病原体以EV71较多，其次是CoxA16。