[摘 要] 目的 使用生物信息学方法筛选参与脊髓损伤发展过程中的差异表达基因(DEGs),并于体外 实验探索脂多糖(LPS)激活的 BV2细胞 DEGs的变化情况,以期为脊髓损伤的治疗提供新靶点。方法 从 GEO 数据库下载基因芯片数据,并将数据集中的样本分为脊髓损伤 Day2组和 Day5组,应用 R 软件处理来自 不同数据集样本间的批次效应,对基因芯片的表达数据进行标准化处理,应用 R软件分析标准化后的基因表达 矩阵,以得到差异基因。将差异基因导入 DAVID 数据库进行基因本体论(GO)分析,并通过 KEGG 数据库进 行通路分析。应用STRING 蛋白数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并通过 Cytoscape软件分析得到 10个 Hub基因。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)分析 LPS激活后 BV2小胶质细胞 Hub基因中分值 高的前2个基因。结果 与 Day2组比较,Day5组有340个 DEGs,对其生物信息分析发现,DEGs富集于细胞 炎症反应和物质代谢中。通过STRING 软件进行模块分析得出10个中心节点,10个基因经 KEGG 再次分析 后发现 CXCL10、CCR3、CCR10和 CCL2基因显著富集于趋化因子信号通路和细胞因子-细胞因子受体相互作 用。体外实验中,与正常组比较,LPS组炎性细胞因子[白细胞介素-1β(IL-1β)、IL-6和肿瘤坏死因子α(TNF- α)]表达水平及趋化因子 CXCL10、CCR9/10和 CCL2mRNA 表达量均增加,差异均有统计学意义(P<0.05)。 结论 CXCL10、CCR3、CCR10和 CCL2趋化因子信号通路和细胞因子-细胞因子受体相互作用等可能与脊髓 损伤发展机制关系密切。CXCL10、CCR9/10和 CCL2介导了 BV2细胞炎症反应。