基于生物信息学分析幽门螺杆菌感染与骨质疏松症的相关性
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基金项目:重庆市科卫联合重点项目(2018ZDXM009);重庆医科大学研究生智慧医学专项研发计划项目(YJSZHYX202116);重庆医科大 学研究生创新基金项目(YJSCX202108)。


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    [摘 要] 目的 利用生物信息学分析幽门螺杆菌(HP)感染与骨质疏松症(OP)的关系。方法 通过 Disgenet、OMIM、TTD、GeneCards、Pharmgkb等基因数据库查找引起 OP和 HP感染的疾病基因,构建疾病共 同基因的蛋白互作网络并筛选出关键靶点基因,通过 DAVID 数据库进行基因本体论(GO)功能和京东基因与 基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 通过相关基因数据库筛选出获得 OP相关基因493个,HP感 染相关基因798个,通过取交集后获得69个 HP感染与 OP共同靶点基因。GO 功能主要富集在序列特异性 DNA 结合转录因子活性的正向调节、Ⅰ-κB激酶/核因子κB信号传导等方面,KEGG 通路包括人巨细胞病毒感 染、沙门菌感染等信号通路。HP感染与 OP的关键靶点基因为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、清蛋白、CTNNB1、 雌激素受体1、白细胞介素1B、白细胞介素6、瘦素、基质金属蛋白酶-9、MYC、肿瘤坏死因子等。结论 HP感 染多通过导致炎性反应产生炎症因子,从而作用于影响骨吸收及骨形成的信号通路,最终导致或加重 OP。

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唐 杨,邵高海.基于生物信息学分析幽门螺杆菌感染与骨质疏松症的相关性[J].现代医药卫生,2023,39(19):3257-

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