基于生物信息学探索let-7c-5p通过靶向OLFM4参与 支气管哮喘疾病进展研究
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    [摘 要] 目的 基于生物信息学探索let-7c-5p通过靶向OLFM4参与支气管哮喘疾病进展。方法 选 取基因表达公共数据库(GEO)中芯片数据集 GSE207751和GEO222894,采用R软件的“Limma”和“DESeq2” 软件包分析2个数据集中的差异表达基因(DEGs)和差异miRNA。利用hclust函数进行WCGNA 分析。应用 “ClusterProfiler”软件包进行基因本体(GO)功能注释富集分析和京都基因与基因组百科全书信号通路富集分 析,STRING数据库建立蛋白互作网络(PPI网络),Cytoscape筛选严重哮喘患者的核心基因。miRWalk、miRBase 和miRTarBase数据库用于靶基因的miRNA 预测。结果 分析获得80个DEGs,包括上调的OLFM4, 进行WCGNA 分析后发现和哮喘严重程度相关的Darked模块基因24个,之后进行PPI网格构建和mRNAmiRNA 预测筛选出4个核心上调基因(包括OLFM4)和6个miRNA(包括hsa-let-7c-5p)。分析获得98个差 异表达miRNA,其中上调5个,下调93个。进行轻度哮喘患者和重度哮喘患者差异miRNA 交叉分析发现, let-7c-5p在轻度哮喘患者和重度哮喘患者中表达下调。结论 研究多重验证了在哮喘患者中,let-7c-5p通过 调控OLFM4影响哮喘的气道炎症和气道重塑,参与哮喘疾病进展,有利于了解哮喘疾病状态进展的潜在分子 机制,同时验证了let-7c-5p成为哮喘潜在生物标志物的潜力,为进一步研究哮喘疾病进展提供理论基础。

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刘锡娇,黎友伦△.基于生物信息学探索let-7c-5p通过靶向OLFM4参与 支气管哮喘疾病进展研究[J].现代医药卫生,2024,40(11):1833-1839

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  • 在线发布日期: 2024-06-20
  • 出版日期: 2024-06-15
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