脓毒症患者存活率低、死亡率高、预后差，早期识别其病原体尤为关键。宏基因组二代测序(mNGS)能实现无偏倚检测临床样本中的所有微生物，对早期发现脓毒症病原微生物较传统培养技术等更灵敏、准确、高效。随着二代测序技术的不断发展，mNGS在诊断脓毒症方面的临床应用价值将进一步提高，该文就mNGS在脓毒症早期诊断中的优势、临床应用及进展、挑战与展望进行综述。