目的通过生物信息学分析结合临床样本检测，寻找膀胱尿路上皮癌（BLCA）中关键基因的突变和机制探讨。方法下载TCGA（406例肿瘤组织和19例癌旁组织）和GTEx（21例癌旁组织）数据库中全部BLCA病例数据集的基因突变数据、转录组数据和临床数据。收集BLCA手术临床样本共32例，实时荧光定量聚合酶链反应（PCR）检测基因表达。结果91.42%的患者存在突变，其中错义突变、单核苷酸变异和C>T突变为主要突变类型，突变排在前5位的基因分别为TP53（47%）、TTN（45%）、KMT2D（29%）、MUC16（28%）、KDM6A（26%）。TCGA和临床样本中，KDM6A突变型表达水平均显著高于野生型（P=0.008、0.007）。KDM6A野生型的总体生存期（OS）和无进展生存期（PFS）均大于突变型（P=0.028、0.035）。进一步研究发现，KDM6A的表达与CD8 +T细胞（r=0.22，P=0.039）、巨噬细胞（r=0.31，P=0.032）和内皮细胞（r=0.26，P=0.002）水平均呈显著正相关。结论BLCA中KDM6A的突变与预后和免疫微环境密切相关，KDM6A突变可能是BLCA的潜在治疗靶标。